EES va înlocui treptat ștampila din pașaport la frontierele externe Schengen, începând din 12 octombrie 2025, cu o înregistrare electronică a intrărilor/ieșirilor pentru cetățenii țărilor terțe, inclusiv R. Moldova, folosind date alfanumerice și biometrice: fotografie facială și patru amprente digitale, colectate la prima trecere pentru crearea unui profil; la următoarele călătorii verificarea se face rapid pe baza biometriei, sistemul calculând automat cele 90/180 de zile și reducând așteptarea; implementarea este etapizată până la 170–180 de zile, timp în care ștampilarea continuă parțial, fără a restrânge drepturile de călătorie existente